Laboratorium Sistem Informasi (LSI) merupakan salah satu fasilitas yang disediakan oleh Politeknik Negeri Malang untuk para mahasiswa Jurusan Teknologi Informasi untuk melakukan praktikum pengembangan Sistem Informasi. Terdapat 2 buah ruang LSI yang dimiliki oleh jurusan TI. Di dalam lab ini, tidak diberikan perangkat PC karena para mahasiswa dianjurkan untuk menggunakan laptop pribadi yang dimiliki. Ruangan di-set sedemikian rupa sehingga dapat mudah untuk digunakan kolaborasi bagi mahasiswa dalam pengembangan sistem informasi. Laboratorium yang terletak di Gedung AF lantai 1 ini memiliki kapasitas 32 orang. Untuk menunjang kegiatan perkuliahan, laboratorium ini memiliki 1 buah LCD dan 1 buah proyektor agar presentasi dari dosen bisa lebih jelas dan efektif.
Pencahayaan dan sirkulasi udara pada laboratorium ini terhitung cukup baik karena terdapat jendela-jendela yang cukup besar ditambah 1 AC untuk sirkulasi udara dalam Laboratorium.
Laboratorium ini dilengkapi dengan CCTV pada sudut ruangan. Tidak hanya itu, fasilitas lainnya adalah 1 buah whiteboard dan 1 lemari. Laboratorium ini biasanya digunakan untuk mata kuliah Sistem Informasi.