Program Studi Manajemen Informatika berdiri 24 Juni 2005 berdasarkan SK Mendiknas Nomor : 2001/D/T/2005 di bawah Jurusan Teknik Elektro Politeknik Negeri Malang. Dalam surat keputusan tersebut Politeknik Negeri Malang diberikan ijin untuk menyelenggarakan pendidikan Program Studi Manajemen Informatika untuk jenjang program Diploma (DIII) Politeknik.

Program Studi Manejemen Informatika melakukan perubahan pada sebagian kurikulumnya menyesuaikan perkembangan teknologi informasi dan kebutuhan dunia kerja saat ini. Mulai tahun akademik 2006/2007, kurikulum Program Studi Manejemen Informatika menggunakan kurikulum 5-1 (lima semester di kampus dan satu semester di Industri) yang ditawarkan dengan jumlah total 120 SKS. Dan mulai tahun 2009 s/d sekarang sudah diterapkan kurikulum berbasis proyek untuk semakin mendekatkan mahasiswa pada pengalaman praktik di lapangan